围绕航空、航天、船舶、兵器、核工业、交通运输与电子通信等我国重大复杂装备系统，以需求为导向，研究面向复杂系统全生命周期的复杂系统工程基础理论、建模方法和分析技术，为需求方提供确保复杂系统成功实现的跨学科方法和手段。中心旨在发展复杂系统工程学科，面向国家重大工程，提升我国系统工程领域在国际上的学术地位及影响力；推进系统工程在工业界的应用和实践，推动我国重大装备研制创新以及体系工程能力的快速发展。

研究方向：复杂组织体架构（EA），复杂系统工程（CSE）、体系工程（SoSE）和基于模型的系统工程（MBSE）的方法论、技术、工具及相关应用研究等。