综合论文训练是清华工业工程本科生教育的关键组成部分，是训练学生应用所学知识解决实际问题的能力，培养创新意识和创新能力的综合环节。综合论文训练一般需要12 - 18周，在第四学年结束的时候完成。学生必须通过以下的考核，才能获得学士学位。

　　工业工程系对于综合论文训练的各个环节都予以高度重视，并采取积极措施来保障综合论文训练的顺利进行和论文质量： 

　　进行充分的准备：第7学期结束后，寒假前即召开毕业设计动员会，为学生指定导师和确定题目。学生可充分利用假期时间进行调研和准备。 

　　执行规范的检查：开题到答辩的历次检查，至少4位老师出席，全体学生必须全程出席。

　　重视教师的投入程度：指导教师每周对学生的工作进展和质量进行检查，并保证足够的时间与学生直接见面，针对论文工作进行交流。  

　　重视对科学素养的培养：对论文规范性严格要求，培养学生基本的科研素养。